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Projet 1 / 5
Référentiel taxonomique
Maintenir à jour la liste des noms scientifiques des Lépidoptères de France
Programme
TAXREF
Partenaire
PatriNat (MNHN)
Couverture
Lépidoptères de France
Coordination
4 experts bénévoles
Toute donnée d'observation a besoin d'un nom. Et pour que ce nom ait un sens pour tous, il doit être partagé, validé, mis à jour. C'est précisément le rôle d'un référentiel taxonomique : fournir à l'ensemble des acteurs (chercheurs, gestionnaires, naturalistes, institutions) une liste structurée, à jour, des noms scientifiques utilisés en France.
Pour les Lépidoptères de France métropolitaine, c'est oreina qui assure ce travail, en partenariat avec PatriNat (MNHN, OFB, CNRS), dans le cadre du référentiel national TAXREF.
L'enjeu
Pourquoi un référentiel taxonomique ?
Une espèce de papillon, ce n'est pas qu'un nom : c'est un nom et une définition scientifique. Cette définition évolue continuellement, avec l'avancée des connaissances. Une espèce peut être divisée en plusieurs (lorsqu'on découvre que ce qu'on prenait pour une seule espèce regroupe en réalité des entités distinctes), regroupée avec une autre, déplacée d'un genre à un autre, ou simplement renommée pour des raisons de priorité nomenclaturale. Avec l'avènement des outils moléculaires, ces évolutions s'accélèrent : le barcoding et les analyses phylogénétiques révèlent fréquemment des espèces cryptiques, des hybrides ou des erreurs de circonscription.
Sans référentiel partagé, ces évolutions deviennent un casse-tête. Une donnée saisie en 2010 sous un nom devenu invalide en 2024 doit pouvoir être reliée au nom actuel. Une carte de répartition réalisée à partir de plusieurs sources doit pouvoir agréger des données saisies sous des noms différents pour la même espèce. Une politique de conservation (Liste rouge, espèce protégée) doit pouvoir suivre une espèce même si son nom change.
TAXREF est le référentiel qui rend tout cela possible à l'échelle nationale. Il est porté par PatriNat (Office français de la biodiversité, Muséum national d'Histoire naturelle, CNRS) et publié en versions annuelles. C'est l'épine dorsale du Système d'Information sur la Biodiversité (SIB), qui irrigue l'INPN, le SINP, les politiques de conservation et l'ensemble des bases naturalistes nationales.
Le rôle d'oreina
Partenaire référent de PatriNat sur les Lépidoptères
Depuis plusieurs années, oreina est partenaire référent de PatriNat pour la mise à jour de TAXREF concernant les Lépidoptères de métropole. Concrètement, cela signifie qu'une équipe de quatre experts bénévoles, spécialistes de différents groupes (Rhopalocères, Géométridés, Noctuoidés, Microlépidoptères), assure :
- une veille bibliographique continue sur les publications scientifiques mondiales décrivant de nouvelles espèces, de nouvelles combinaisons ou apportant de nouvelles données génétiques pertinentes pour la faune de France ;
- l'analyse des publications au regard du référentiel français existant : telle synonymie est-elle robuste, telle révision est-elle suffisamment documentée pour être intégrée, tel changement de combinaison concerne-t-il bien des taxons français ;
- la proposition de mises à jour via l'interface en ligne TAXREF-Web développée par PatriNat ;
- la rédaction de notes explicatives qui accompagnent chaque modification, pour que les utilisateurs du référentiel puissent comprendre les implications, et notamment savoir comment traiter leurs données antérieures.
Ce travail, essentiellement bénévole, est appuyé depuis 2024 par la coordinatrice scientifique salariée de l'association, qui assure le lien avec PatriNat et l'animation du groupe d'experts.
Chiffres-clés
TAXREF en chiffres (Lépidoptères de France métropole)
État du référentiel et bilan d'activité oreina, exercice 2024.
44 649
noms scientifiques recensés dans TAXREF (tous Lépidoptères)
20 945
noms recensés pour la France métropolitaine
5 683
espèces valides documentées en métropole
286
nouveaux noms intégrés en 2024 (dont 228 à l'échelle spécifique)
15
espèces nouvelles signalées en France en 2024
~400
nouveaux noms prévus à l'horizon 2028
Sources : documents projet TAXREF et bilan d'activité 2024 d'oreina.
Méthodologie
De la publication à TAXREF
Chaque modification de TAXREF suit un processus formalisé qui garantit la traçabilité scientifique de chaque changement.
1
Détection
Un membre de l'équipe repère, dans une publication récente, une information taxonomique pertinente.
2
Analyse
L'équipe évalue la robustesse de la proposition : qualité du journal, argumentation, pertinence pour la faune française.
3
Documentation
Les références sont intégrées dans DOC-Web, l'outil de gestion bibliographique de PatriNat. En 2024, 440 liens nom-référence ont été établis.
4
Proposition
Le changement est proposé via TAXREF-Web. Pour les modifications à fort impact, une note explicative est rédigée.
5
Diffusion
Répercussion immédiate sur Artemisiae via Systema, intégration dans la version annuelle suivante de TAXREF, relais dans Lepis et article de synthèse annuel dans Chersotis.
Outil associé
Systema : la gestion du référentiel en continu
TAXREF est publié en versions stabilisées annuelles. Or l'expertise taxonomique, elle, ne s'arrête pas à un calendrier de versionnage : une publication scientifique paraît, une révision s'impose, et il faut pouvoir en tirer les conséquences sans attendre douze mois. C'est précisément ce que permet Systema, le module de gestion taxonomique développé par oreina sur la plateforme Artemisiae.
Une connexion temps réel à TAXREF-Web
Systema repose sur une API qui se connecte en temps réel à TAXREF-Web, l'outil applicatif de PatriNat. Cette architecture permet à oreina de gérer le référentiel des Lépidoptères de France en continu, sans dépendre du rythme des versions stabilisées annuelles. Une décision taxonomique prise par l'équipe d'experts est immédiatement répercutée dans Systema, et donc visible par les utilisateurs d'Artemisiae, qu'il s'agisse de saisie de données ou de consultation des fiches taxons.
Cette gestion en continu se traduit par trois fonctionnalités structurantes.
Suivi nomenclatural en temps réel
Liste systématique complète des Lépidoptères de France, organisée en familles, sous-familles, tribus et genres. Pour chaque taxon, une fiche indique le nom valide, l'auteur et l'année de description, les synonymes et l'historique nomenclatural, immédiatement à jour.
Gestion de l'ordination des taxons
L'ordre dans lequel les taxons sont présentés (au sein d'un genre, d'une tribu, d'une famille) reflète la classification scientifique du moment. Avec l'avancée des travaux phylogénétiques, cet ordre évolue. Systema permet de réordonner les taxons selon les usages scientifiques actuels, en suivant les publications de référence, sans attendre que ces évolutions soient reprises dans la version officielle suivante de TAXREF.
Notes taxonomiques sourcées
Chaque prise de position de l'équipe (acceptation d'une révision, refus d'une synonymie proposée, choix entre plusieurs combinaisons concurrentes) fait l'objet d'une note taxonomique argumentée. Ces notes sont rattachées aux références scientifiques de l'index bibliographique d'Artemisiae, garantissant la traçabilité de chaque décision et permettant à l'utilisateur de remonter à la publication source.
L'ensemble de ces informations est consultable à la fois sur la liste systématique générale et directement sur les fiches taxons d'Artemisiae. Systema est librement accessible, sans inscription préalable.
Consulter Systema sur Artemisiae
Pour aller plus loin
Ressources externes et publications associées au projet TAXREF.
Contribuer
Vous pouvez contribuer
Le travail taxonomique d'oreina repose entièrement sur l'expertise bénévole. Plusieurs voies de contribution sont possibles, selon votre niveau de spécialisation.
Vous êtes lépidoptériste expérimenté ?
Si vous suivez régulièrement une famille ou un groupe (Microlépidoptères, Géomètres, Noctuelles…) et que vous lisez la littérature scientifique récente, votre contribution à la veille bibliographique nous serait précieuse.
Vous avez identifié une publication récente importante ?
Signalez-nous l'article via la page Contact, en précisant les taxons concernés. Nous l'intégrerons à notre veille.
Vous avez détecté une incohérence dans Systema ?
Toutes les remontées d'utilisateurs sont précieuses : elles permettent d'améliorer la qualité du référentiel.
Découvrir les autres projets
oreina structure son action scientifique autour de cinq projets complémentaires. TAXREF est l'un d'entre eux ; les quatre autres lui sont étroitement articulés.