Le référentiel qui attribue, taxon par taxon et stade par stade, un niveau de difficulté d'identification — et les exigences documentaires associées sur Artemisiae
Format
CSV — référentiel + attribution
Cible
Observateurs, validateurs, plateformes
Accès
Libre, versionné, citable
Rattachement
Projet IDENT
Tous les Lépidoptères n'offrent pas la même prise à l'identification. Certains se reconnaissent d'un coup d'œil ; d'autres réclament l'examen attentif d'une bonne photographie ; d'autres encore ne livrent leur identité qu'au prix d'une préparation génitalique, d'un élevage, d'un enregistrement sonore ou d'un séquençage.
Le référentiel des niveaux de détermination formalise cette inégalité : il attribue à chaque taxon, et pour chaque stade biologique, un degré de difficulté qui détermine la nature de la preuve à fournir et le niveau de validité atteignable par la donnée. C'est l'outil structurant qu'utilise Artemisiae pour qualifier ses 6 000+ taxons.
La grille présentée ici n'est pas une typologie concurrente de la typologie T1-T5 développée par PatriNat (MNHN), qui structure le projet IDENT à l'échelle nationale. Elle en est la déclinaison opérationnelle pour la saisie sur Artemisiae : là où T1-T5 décrit la difficulté intrinsèque d'identification d'un taxon (à vue, à vue + manipulation, dissection, séquençage), la grille Artemisiae traduit cette difficulté en exigences documentaires concrètes (preuve à fournir, validation automatique ou manuelle, validité atteignable) et y ajoute des dimensions spécifiques aux Lépidoptères : identification sonore, identification moléculaire, complexes systématiques, mines et fourreaux.
Concrètement, un observateur n'a pas besoin de connaître la typologie PatriNat pour saisir une donnée — il rencontre la grille Artemisiae, qui lui indique directement : « pour cette espèce, à ce stade, une photo couvrant tel critère est attendue ». La cohérence est assurée à la conception du référentiel par le COTECH IDENT.
Comprendre, dès la saisie, le niveau d'exigence attendu : quelle preuve fournir, quel type de critère regarder, à quel stade.
Standardiser les exigences documentaires (photo, série, dissection, son, barcode) et automatiser ce qui peut l'être pour les taxons aisés.
Attribuer aux données un niveau de validité (« probable », « très probable ») cohérent avec la qualité de la preuve apportée.
L'objectif n'est pas de décourager la saisie des taxons difficiles, mais d'afficher honnêtement le coût épistémique de chaque identification et de garantir la traçabilité scientifique du jeu de données. Une donnée « probable » n'est pas une mauvaise donnée : c'est une donnée dont on dit ce qu'elle peut faire.
Pour les niveaux 1 et 2, la validation peut être automatique. À partir du niveau 3, elle devient nécessairement humaine et exige une preuve documentaire dont la nature est définie a priori.
| Niveau | Libellé | Validation | Exigence documentaire | Validité atteignable |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Taxon à identification aisée | Automatique | Aucune preuve à l'appui | « probable » |
| 2 | Taxon confondable | Automatique | Photo visualisant les critères | « probable » à « très probable » |
| 3 | Taxon rare | Manuelle | Photos couvrant tous les éléments diagnostiques, voire spécimen | « très probable » |
| 4 | Taxon à détermination difficile | Manuelle | Bino + loupe ; dissection souvent nécessaire ; élevage si chenille | « très probable » |
| 5 | Identification sonore | Manuelle / Auto | Enregistrement sonore | « très probable » |
| 6 | Identification moléculaire | Manuelle | Séquence barcode COI | « très probable » |
| 7 | Complexes systématiques (« bordéliques ») | Approche écologique | Proposition du complexe à la saisie (ex. Phengaris) | — |
Un niveau distinct par stade biologique. Un même taxon peut être attribué à un niveau 2 au stade adulte et à un niveau 4 au stade chenille, ou inversement. Le référentiel organise donc l'attribution en cinq colonnes : Adulte, Chenille, Œuf, Chrysalide, Indéterminé, complétées par une colonne mine/fourreau.
Les stades larvaires mineurs et fourreaux — typiques de nombreuses familles de Microlépidoptères (Coleophoridae, Gracillariidae, Nepticulidae, Elachistidae…) — appellent une approche spécifique. Quatre catégories ont été définies.
Donnée acceptée sans nécessité de poster une photo (taxon déjà documenté pour l'observateur).
Équivalent niveau 2
Photo(s) de la mine ou du fourreau + indication de la plante nourricière.
Équivalent niveau 2
Photo(s) de la mine (œuf inclus) ET de la larve/chrysalide + plante nourricière.
Équivalent niveau 4
Photo(s) + plante nourricière + élevage nécessaire ; dissection éventuelle.
Équivalent niveau 4
Deux règles transversales encadrent ces catégories :
L'attribution est conduite taxon par taxon, en mobilisant quatre sources :
Techniquement, le référentiel s'appuie sur deux fichiers : niveaux_determination.csv (le référentiel lui-même) et resultats_determination.csv (l'attribution taxon par taxon). Les deux sont intégrés au schéma PostgreSQL d'Artemisiae avec contraintes d'intégrité référentielle, et chaque attribution peut être documentée par un commentaire libre.
État du référentiel à la version actuelle. La grille n'est pas figée : elle s'enrichit et se révise au fil des décisions du COTECH IDENT.
6 141
taxons ont reçu une attribution de niveau
répartis entre les quatre observatoires d'Artemisiae
3 240
52,8 %
Microlépidoptères
2 441
39,7 %
Hétérocères
357
5,8 %
Rhopalocères
90
1,5 %
Zygènes
Sur les 6 059 taxons documentés au stade adulte.
Lecture : environ 47 % des taxons français se rangent dans les niveaux 1 et 2 (validation automatique potentielle), tandis que plus de 53 % relèvent des niveaux 3 ou supérieurs, soit une validation humaine obligatoire.
| Observatoire | Niveaux 1+2 (aisé/confondable) | Niveau 4 (difficile) |
|---|---|---|
| Rhopalocères | 80,2 % | 15,4 % |
| Hétérocères | 64,3 % | 16,3 % |
| Zygènes | 34,4 % | 64,4 % |
| Microlépidoptères | 30,0 % | 63,4 % |
Ce contraste documente quantitativement une réalité bien connue : les Rhopalocères se prêtent à une identification de terrain dans quatre cas sur cinq, tandis que les Zygènes et plus encore les Microlépidoptères exigent une validation experte dans près de deux tiers des cas.
996 taxons disposent d'une attribution dans la grille mines/fourreaux, presque exclusivement en Microlépidoptères. La distribution montre une dominance de la catégorie la plus exigeante :
Familles les mieux couvertes : Coleophoridae (296), Gracillariidae (177), Nepticulidae (168), Elachistidae (115).
La documentation des stades précoces est encore parcellaire — c'est un chantier en cours. L'écrasante majorité des taxons documentés à ces stades relève du niveau 4.
Le référentiel est un objet vivant. Il est révisé au fil des décisions du COTECH IDENT, des compléments documentaires apportés par le réseau et des évolutions taxonomiques (TAXREF). Chaque version est archivée, datée et identifiable pour permettre la traçabilité dans les publications et rapports d'étude qui s'y réfèrent.
Référentiel complet (7 niveaux + catégories mines/fourreaux) et attribution taxon par taxon pour les quatre observatoires d'Artemisiae.
Format CSV (UTF-8) · Encodage taxonomique TAXREF · Documentation jointe au format PDF
Chaque version est numérotée (vMAJEURE.MINEURE) et accompagnée d'un journal de changements :
Toutes les versions antérieures restent accessibles dans l'archive (cf. ci-dessous).
Pour toute réutilisation dans une publication, un rapport d'étude ou un protocole de validation :
Licence : à préciser (Creative Commons recommandée).
Le référentiel n'est pas figé. Plusieurs chantiers structurent les versions à venir.
Pour les Hétérocères et Microlépidoptères, dont la documentation chenille/œuf/chrysalide reste parcellaire.
Les niveaux 5 et 6 sont encore marginaux (20 taxons) mais appelés à croître au fil des nouveaux protocoles.
Liste des complexes systématiques et traitement à la saisie (ex. Phengaris, Pyrgus, agrégats critiques EU-PoMS).
Afficher le niveau d'exigence attendu directement dans l'interface d'Artemisiae, dès le choix du taxon.
Vous êtes spécialiste d'un groupe et vous repérez une attribution discutable, un complexe à intégrer, un stade à documenter ? Le COTECH IDENT examine les propositions du réseau au fil de l'eau. Chaque retour, chaque cas-limite documenté nourrit la prochaine version.
Le référentiel des niveaux de détermination est l'un des outils du projet IDENT. Il dialogue avec les autres briques de la connaissance et de la qualification des données.
Le cadre méthodologique : typologie T1-T5 PatriNat, agrégats, sympatrie, cartes ABDSM.
Les webinaires dédiés aux complexes d'espèces — la pédagogie qui complète le référentiel.
La qualification des données d'observation, dont la grille est un ingrédient central.
Le portail de saisie où la grille est mobilisée au quotidien par observateurs et validateurs.
